При гетерохромії принцип рівномірного розподілу меланіну порушено. Спостерігається підвищена концентрація меланіну – або в одній з райдужок, що призводить до очей різного кольору, або на певній ділянці райдужної оболонки, тоді око буде двоколірним. Гетерохромія буває вродженою та набутою.