Найкраще зберігати перцеві запаси на спеціально обладнаних стелажах, піднятих над землею. Болгарський перець слід укласти у картонні коробки чи дерев'яні ящики, дно застелити папером. Плоди акуратно викладають шарами (не більше 2-3 шарів), пересипаючи їх сухим піском або тирсою.