Проїзд на МЦД можна оплатити транспортною карткою «Трійка», банківськими та соціальними картами, смартфоном з платіжним додатком та NFC. Вартість подорожі залежить від зони МЦД. Їх три: «Центральна», «Передмістя» та «Дальня». Крім того, на МЦД діють квитки та абонементи на електрички.
необхідно обов'язково валідувати при вході та виході зі станцій, щоб уникнути блокування картки.
Для перепрограмування квитка «Гаманець» на карті «Трійка» в автоматах продажу квитків необхідно поповнити його мінімум на 1 рубль. Для оплати проїзду на МЦД абонементом необхідно записати новий квиток, що дає право проїзду в зонах «Центральна» та «Пригород», або тільки в «Центральна» зоні МЦД. Збережена копія
Пересадки між МЦК та метро Протягом 90 хвилин після першого проходу через турнікети можна безкоштовно пересісти з метро на МЦК або з МЦК на метро. При цьому важливо робити пересадку на тих станціях, де її передбачено.