Метиленовий синій є синтетичним барвником синього кольору. Його розчини застосовуються для позбавлення від грибкових інфекцій у домашніх акваріумах, що викликають такі, зокрема, захворювання акваріумних риб, як дерматомікоз та бранхіомікоз (зяброва гниль).